当反渗透纯净水设备的进水为常规的自然水体时（如地表水和自来水、地下水等），水中含有CO2（二氧化碳），而CO2在水中会与HCO3－和CO3２－之间形成一定的离解平衡，由于RO膜可以脱除溶解性的离子而不能脱除溶解性的气体，所以RO产水中的CO2含量与RO进水中CO2的含量基本相同，但是HCO3－和CO3２－常常能够减少1～2个数量级，这样就会打破进水中CO2、HCO3－和CO3２－之间的离解平衡，在系列反应中，CO2将与H2O结合发生如下反应平衡的转移，直到建立新的平衡。

如果进水中含有CO2，则RO的产水pH值总会降低，对于大多数RO系统反渗透产水的pH值将有1～2个pH值的下降，当进水碱度和HCO3－高时，产水的pH值下降就更大。为数极少的进水，含较少的CO2、HCO3－或CO3２－这样看到产水pH值的变化就少。总的来说，反渗透纯水机产水的pH值在6～8之间，产水的pH值与进水的pH值关系很大，大体上成正比例变化。在某些国家和地区，对于饮用水pH值有规定，一般为6.5～9.0，据了解，这是为了防止输水管路的腐蚀。

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