在运行过程当中，系统的运行条件，如压力、温度、系统回收率和给水浓度可能有变化而引起产水流量和质量的改变，为了有效地评价系统的性能，需要在相同的的条件下比较产水流量和质量数据，因为不可能总是在相同的条件下获得这些数据，因此需要将实际运行状况下的RO性能数据按照恒定的运行条件进行标准化，以便评价RO膜的性能。标准化包括产水流量的标准化和盐透率的标准化。
如果系统运行条件与初投运行时相同，现在理论上所能达到的流量，称标准化的流量。如果系统运行条件与初投运时相同，现在理论上所能达到的脱盐率称标准化的脱盐率。
从上述定义可以知道，标准化的参考点是以初投运时（稳定运行或经过24小时）的运行数据，或者由反渗透膜元件制造厂商的标准参数做参考，此时反渗透膜基本上没有受到任何污染，今后要判断反渗透是否存在污染以及是否需要清洗，都需要以初投运时的数据来判断，因此，初投运时的数据尤其重要，必须进行记录。
反渗透系统一定要有完整的运行数据的记录：给水压力、中间压力、浓水压力、给水流量、浓水流量、给水电导率（或者是TDS)、产水电导率、浓水电导率（或者是TDS）、给水PH、给水温度、给水ORP。将每天的运行数据录入反渗透的标准化软件，标准化软件能以图形的方式将系统运行的情况体现出来，方便管理人员判断系统是否出现异常情况，及时检查设备、调整参数，避免事故发生。
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